Padj值是什麼意思

"padj" 這個術語在不同的領域可能有不同的含義，但通常在生物學和生物信息學中，它指的是 "p value adjusted" 或 "adjusted p value"。在統計學中，p值是對某一假設檢驗結果成立機率的一種度量，它表示了在零假設為真的前提下觀察到給定結果或更極端結果的可能性。

調整後的p值（padj或p.adjust）是在進行多重比較校正時計算的，以控制假陽性率（FDR, False Discovery Rate）。在生物學的背景下，這可能涉及到對基因表達數據進行差異表達分析，以確定哪些基因在不同的實驗條件下表達水平發生了顯著變化。

調整p值的方法有很多種，包括Bonferroni校正、Holm-Bonferroni法、Benjamini-Hochberg法（FDR法）、Benjamini-Yekutieli法等。這些方法的目標是在進行多個獨立比較時，控制錯誤發現率，即在整個結果集中，錯誤地認為某個比較結果顯著的比率。

在使用padj時，通常一個較小的值表示該結果更有可能是真實的生物學差異，而不是偶然發生的。然而，padj的閾值選擇取決於研究的具體情況，包括研究設計、樣本數量、生物學背景等。通常，研究者會選擇一個較小的padj值（如<0.05或<0.01）來確保結果的顯著性和可靠性。