富集分析是什麼意思

富集分析（Enrichment Analysis）是一種生物信息學方法，用於識別和解釋高通量數據集中顯著富集的生物學功能或 pathways。這種方法通常用於基因表達數據、蛋白質相互作用網路、基因組變異數據等，以揭示潛在的生物學意義。

富集分析的基本步驟如下：

確定背景：首先需要確定分析的背景，例如是整個基因組、一個特定的細胞類型中的基因集合、或是一個已知的生物學通路等。
數據收集：收集與研究相關的數據，例如基因表達水平、基因突變信息等。
功能分類：將收集到的數據根據其功能或通路進行分類。這可以通過現有的資料庫如 Gene Ontology（GO）、 Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）或 Reactome 等來實現。
富集統計：計算每個功能類別或通路中觀察到的基因數與預期基因數的比例。通過統計學方法（如 Fisher's exact test 或 Chi-squared test）來評估這種比例是否顯著高於隨機預期。
結果解釋：根據統計分析的結果，識別那些富集顯著的功能類別或通路。這些結果可能揭示了數據集中基因的共同生物學特徵，從而幫助研究者理解數據背後的生物學機制。

富集分析在生物醫學研究中非常有用，因為它可以幫助研究者從大量的數據中識別出具有生物學意義的模式，從而指導進一步的實驗設計和驗證。